Yhteenveto
Saatat olla laivaston kuumin pilotti, mutta tämä laittaa sinut jäähylle! Wing Commander -pelissä räjäytät tiesi läpi Vega-kampanjan. Olisi parasta, että olet maineesi veroinen, sillä panokset ovat liian korkeat pelkän varman päälle pelaamiseen. Juuri kun luulet, ettei toiminta voi enää olla intensiivisempää tai vastustajat kovempia, sukellat Wing Commander II:een. Hävitettynä ja epäoikeudenmukaisesti sotaoikeuteen asetettuna sinun täytyy todistaa kykysi uudelleen ja ansaita Konfederaation ylijohdon kunnioitus. Tietenkin on myös pieni asia estää Terranin kotimaailmojen tuhoaminen.
Tarina
Kun Tiger's Claw hyökkäsi K'tithrak Mangin kimppuun, kohtasit useita hävittäjiä, jotka katosivat salaperäisesti näkyvistä. Jopa tutka ei pystynyt seuraamaan niitä! Et halunnut aiheuttaa paniikkia Claw'lle, koska luulit kyseessä olevan tutkan toimintahäiriö, joten lähdit etsimään aavemaisia hävittäjiä. Etsintä viivytti paluutasi Claw'lle juuri sen verran, että hävittäjät ehtivät tuhota onnettoman lentotukialuksen.
Laskettuasi TCS Austinille, sait tietää olevasi ainoa pilotti, joka oli kohdannut nämä "stealth"-hävittäjät. Lisäksi lentotallennuslevysi katosi salaperäisesti heti laskeutumisen jälkeen. Jouduit sotaoikeuteen, jossa sinua syytettiin maanpetoksesta, ja väitteesi stealth-hävittäjistä jätettiin huomiotta. Todisteiden puutteen vuoksi maanpetossyytteet alennettiin pelkäksi huolimattomuudeksi, mutta sait osaksesi tiettyjen lippu-upseerien, kuten amiraali Tolwynin, vihan. Urasi näytti olevan ohi. Olet kuitenkin yhä pilotti Terran Confederation Navyssa ja Wing Commander II:ssa tavoitteenasi on voittaa Kilrathi-vihollinen. Jokainen lentämäsi tehtävä (ja onnistumisesi tai epäonnistumisesi kussakin tehtävässä) vaikuttaa Konfederaation mahdollisuuksiin saavuttaa lopullinen voitto.