Yhteenveto
Perfect Cherry Blossom -pelissä on kolme pelattavaa hahmoa, joista jokaisella on kaksi erilaista taitosettiä. Reimu Hakurei on suhteellisen tasapainoinen kaikilla osa-alueilla. Marisa Kirisame liikkuu nopeammin ja käyttää voimakkaampia, mutta lyhyemmän kantaman omaavia hyökkäyksiä. Sakuya Izayoi liikkuu hitaammin ja käyttää heikompia hyökkäyksiä, jotka voivat osua lähes kaikkeen ruudulla.
Merkittävä lisäys Perfect Cherry Blossom -peliin on "Cherry" -pisteytysjärjestelmä. Vihollisten ampuminen kasvattaa Cherry-pisteitä, pommittaminen tai kuoleminen vähentää niitä, ja 50 000 Cherry-pisteen saavuttaminen antaa väliaikaisen suojan. Cherry-pisteet lisäävät lopulta Cherry-mittaria, joka kasvattaa pisteiden määrää, jonka saat piste-esineistä.
Muita tärkeitä muutoksia ovat hahmosi osumakohdan näkyminen keskittyneenä ollessasi, hyökkäysten ominaisuudet riippuen siitä, oletko keskittynyt vai et, ja hyödyllinen kohdistin ruudun alareunassa pomotaistelun aikana, joka näyttää pomon sijainnin.
Peli on myös ainutlaatuinen siinä mielessä, että se sisältää "Phantasm Stagen", joka voidaan pelata vain Extra Stagen läpäisyn jälkeen. ZUN totesi, että pelin Extra Stage oli tarkoitettu "helppotila" -versioksi; mahdollisesti Phantasm Stage oli alkuperäinen Extra Stage kehityksen aikana.
Tarina
PROLOGI
Gensokyossa ihmiset rentoutuvat ja nauttivat loputtoman talven rauhasta. Keväästä ei näy merkkiäkään, vaikka on jo toukokuu, ja lumimyrskyt vain pahenevat. Reimu Hakurei, Hakurein pyhäkössä palveleva miko, on kyllästynyt päivittäiseen kylmyyteen ja haluaa löytää tämän epätavallisen sään lähteen. Marisa Kirisame, mustiin pukeutunut noita, näkee kirsikankukan terälehden leijailevan lämpimän talonsa ulkopuolella ja miettii, onko kevät jossain muualla. Sakuya Izayoi, Scarlet Devil Mansionin palvelusväen johtaja, tietää, että heidän talvivarastonsa hupenevat nopeasti ja haluaa lopettaa tämän pitkän talven ennen kuin ne loppuvat kokonaan. Riippuen siitä, kenet valitset, vain yksi näistä kolmesta sankarittaresta lähtee tutkimaan asiaa.
PÄÄTARINA
Sankaritar aloittaa matkansa suuntaamalla lumikinosten peittämiin metsiin etsimään johtolankoja. Hän taistelee metsässä jääkeiju Cirnoa ja talvihenki Letty Whiterockia vastaan sekä nekomata Chenia Mayohigan kylässä, ilman suurempaa edistystä etsinnöissään. Lopulta, voitettuaan Alice Margatroidin ja hänen nukkeinsa, sankaritar löytää johtolangan huomattuaan useita kirsikankukkia leijumassa taivaalla. Sankaritar seuraa kirsikankukkien polkua korkealle Gensokyon ylle, läpäisten Lily Whiten tervehdykset ja päätyen lopulta suurelle maagiselle rajalle ja poltergeistimuusikoiden Prismriverin sisarusten luo. Hiljennettyään Prismriverin sisarukset, sankaritar ylittää rajan ja saapuu Tuonpuoleiseen.
Taisteltuaan useita haamuja vastaan, sankaritar kohtaa ihmishaudanhoitaja Youmu Konpakun. Youmu selittää, että hän oli varastanut "keväistä" voimaa ympäri Gensokyoa saadakseen Saigyou Ayakashin, youkai-kirsikkapuun, kukkimaan täydellisesti yhdessä Hakugyokuroun puutarhojen kanssa isäntänsä käskystä. Sankaritar voittaa Youmun ja kiirehtii Hakugyokurouhon saadakseen Gensokyon kevään takaisin. Pitkän matkan päätteeksi sankaritar kohtaa Yuyuko Saigyoujin, Hakugyokuroun kummitusprinsessan. Yuyuko paljastaa halunneensa herättää erään sielun, joka on ollut sinetöitynä Saigyou Ayakashin sisällä ennen hänen olemassaoloaan. Sinetin murtamiseksi youkai-kirsikkapuun täytyi kukkia täysin ja täydellisesti. Yuyuko ja sankaritar käyvät kiivaan taistelun: Yuyuko saadakseen sankarittaren sisältämän viimeisen "kevään" täydellistä kirsikankukkaa varten, ja sankaritar saadakseen Gensokyon kevään takaisin. Kun sankaritar voittaa Yuyukon, Saigyou Ayakashi alkaa menettää elinvoimaansa. Sinetti on kuitenkin heikentynyt lähes täydellisen kukinnan myötä, ja sinetöity sielu pääsee hetkellisesti vapaaksi. Sielu on itse asiassa Yuyukon. Sankaritar väistelee hyökkäyksiä, kunnes Yuyukon sielu lopulta sinetöidään uudelleen.



