Yhteenveto
Tässä pelissä on kahdeksan pelattavaa hahmoa, joista neljä muodostavat aluksi valmiit parit ja yksittäiset hahmomoodit ovat avattavissa. Kun pelaat hahmopareilla, toinen hahmo ampuu ollessaan keskittymättömänä, kun taas toinen vaihtuu tilalle ja ampuu keskittyneenä, mikä hidastaa liikkumisnopeutta. Kahden hahmon ampumistyylit voivat olla huomattavan erilaisia. Yksittäisillä hahmoilla, Remiliaa ja Youmua lukuun ottamatta, ampumistyylit eivät muutu keskittyessä/keskittymättä.
Imperishable Night sisältää Last Spellejä. Viholliselle Last Spell on bonusloitsukortti, jonka pelaaja voi haastaa ilman pommien käyttömahdollisuutta ja ilman riskiä menettää elämiä. Pelaajan puolella Last Spellit ovat toissijaisia "pommi"loitsukortteja, jotka kestävät pidempään ja tekevät paljon enemmän vahinkoa kuin tavalliset pommit, mutta kuluttavat kaksi pommivarastoa. Pelaajan Last Spellejä voi käyttää vain heti osuman jälkeen, armonaika on alle sekunti.
Lisäksi pelissä on "Time Orb" -järjestelmä, joka vaikuttaa tarinaan/pisteisiin, sekä mittari, joka seuraa kuinka inhimillinen/youkai (normaali/keskittynyt) olet ja määrittää, kuinka voit kerätä lisää aikaorbeja.
Tarina
Ihmis- ja youkaitiimi lähtee metsätietä pitkin tutkimaan asioita. Matkalla he kohtaavat tulikärpäsen (Wriggle Nightbug) ja yösirkkalinnun (Mystia Lorelei), jotka kukistetaan nopeasti. Seuraavaksi he tapaavat puolieläimen (Keine), joka suojelee ihmisasumusta youkailta. Keine luulee tiimiä vihollisiksi ja hyökkää heidän kimppuunsa. Tiimin voitettua hänet, Keine kertoo, että henkilö, joka vaihtoi kuut, on bambumetsässä. Bambumetsässä he kohtaavat hahmon (joko Reimu tai Marisa), joka vaatii tietämään, miksi tiimi on pysäyttänyt ajan ja aiheuttanut katoamattoman yön.
Lopulta tiimi saapuu syyllisen kartanolle. Sisällä he huomaavat, että kartanoa vartioi parivaljakko kaneja (Tewi ja Reisen). Kanit kukistetaan, mutta eivät ennen kuin hämmentävät tiimiä. Hämmentyneinä tiimin täytyy valita, mitä reittiä he kulkevat (toinen johtaa oikeaan kuuhun ja toinen valehteeseen). Valittuaan oikean reitin he pääsevät tapaamaan tämän ilkikurisen juonen takana olevan henkilön, Kaguyan. Kaguya on piilossa oleva kuun prinsessa, joka on vienyt oikean kuun katkaistakseen yhteyden maan ja kuun välillä. Tiimi palauttaa oikean kuun ja Kaguya haastaa heidät kohtaamaan "5 mahdotonta pyyntöä".



