Yhteenveto
Vuonna 2180 Maan Yhdistyneet Joukot joutuvat salaperäisten Aivojoukkojen hyökkäyksen kohteeksi. Alkuperäisen voiton jälkeen Y.J.:lle, Aivovoimien keskusyksikkö, Ydin Aivot, alkaa lähestyä valovuosien päästä. Pelaaja ottaa hallintaansa prototyyppisen tähtihävittäjän Caesar, joka on rakennettu erityisesti torjumaan Aivojoukkojen uhkaa, ja hänen on voitettava Ydin Aivot ja pelastettava ihmiskunta.