Yhteenveto
Minervassa pelaajahahmo on nimettömänä pysyvä henkilö (pelin sisäisissä viesteissä vihjataan, että hän on karkotettu Overwatch-sotilas), joka on joko hankkinut tai saanut varastetun HEV-puvun. Salaperäinen Minerva ohjaa pelaajaa, joka lähetetään pienelle saarelle, jota miehittää Combine. Saarella on valtava laitos, johon pelaajan on tarkoitus soluttautua ja selvittää sen tarkoitus.