Yhteenveto
Vuosi on 2052 ja maailma on vaarallinen ja kaoottinen paikka. Terroristit toimivat avoimesti – tappaen tuhansia; huumeet, taudit ja saasteet tappavat vielä enemmän. Maailman taloudet ovat romahtamisen partaalla ja kuilu äärimmäisen rikkaiden ja epätoivoisesti köyhien välillä kasvaa yhä suuremmaksi.
Game of the Year -versio sisältää uusimmat pelipäivitykset ja ohjelmistokehityspaketin, erillisen soundtrack-CD:n sekä sivun Deus Ex -pelissä esiintyvästä kuvitteellisesta sanomalehdestä nimeltä The Midnight Sun, joka kertoo pelimaailman viimeaikaisista tapahtumista.
Tarina
Vuoteen 2050 sijoittuvassa dystooppisessa maailmassa tarinan keskiössä on JC Denton, Yhdistyneiden kansakuntien terrorisminvastaisen koalition (UNATCO) palveluksessa oleva terroristien vastainen agentti, joka paljastaa syvän salaliiton matkallaan. Hän kohtaa matkan varrella fiktiivisiä versioita organisaatioista, kuten Majestic 12, Illuminati ja Hong Kongin triadit.
