Yhteenveto
Area 51 on ainoa toiminnantäyteinen ensimmäisen persoonan ammuntapeli, joka sijoittuu Yhdysvaltojen hallituksen salaisimpaan ja turvatuimpaan sotilaslaitokseen. Yhdysvaltain armeija on vastaanottanut hätäkutsun Area 51:stä, jossa viruksen leviäminen on juuri sulkenut tutkimuslaitoksen ja automaattiset karanteenitoimenpiteet ovat lukinneet kaikki tieteelliset ja sotilaalliset työntekijät sisälle. Pieni erikoisjoukkojen yksikkö, jota johtaa vaarallisten aineiden yksikön (HAZMAT) erikoisasiantuntija Ethan Cole, lähetetään tutkimaan tilannetta.
Pelaajana Cole tutkii viisi valtavaa tasoa Area 51:n sisällä, paljastaen viruksen mutageenisen sivuvaikutuksen, joka hallitsee tartunnan saaneiden mieliä, sekä muinaisen, laitoksen alle haudatun avaruusolentojen siirtokunnan. Lukuisten ihmisten ja avaruusolentojen aseiden avulla pelaajat joutuvat selvittämään karmivia salaliittoja, kuten Roswellin avaruusaluksen törmäyksen ja lavastetun kuulaskeutumisen, ratkaistakseen Area 51:n arvoitukset ennen kuin viruksen mutageeni vapautuu ja muuttaa peruuttamattomasti kaiken elämän maapallolla.
Tarina
Heinäkuussa 1947 avaruusalus törmäsi maahan Roswellin lähellä, New Mexicossa, Yhdysvalloissa. Yhdysvaltain ilmavoimat löysi aluksen ja vei sen Area 51:een Nevadaan, missä törmäyksestä selvinnyt ainoa avaruusolento, voimakas Grey nimeltä Edgar, pidettiin vangittuna. Lopulta Grey-olennot avasivat keskustelun Illuminatin kanssa, jota johti arvoituksellinen Mr. White (Phil Proctor), ja tekivät sopimuksen heidän kanssaan. Illuminati antaisi Greylle tutkimuslaitoksen 3 mailia Area 51:n pinnan alapuolella, sallisi heidän käyttää sitä laskeutumispaikkana ja antaisi heille ihmiskokeiden kohteita, jotta he voisivat yhdessä ihmistutkijoiden kanssa kehittää mutageenisen viruksen käytettäväksi sodassa kotiplaneetallaan. Vastineeksi Grey-olennot antaisivat Illuminatille yksinoikeuden käyttää heidän teknologiaansa. Illuminati käytti osaa tästä teknologiasta väestön vakoilemiseen.
Lopulta Grey-olennot ja ihmistutkijat kehittivät voimakkaan avaruusolennon – tunnetun nimellä "Theta", joka levitti virusta. Monet projektin parissa työskennelleistä tiedemiehistä eivät tienneet, että Grey-olennot ja Illuminati suunnittelivat myös käyttää virusta maapallon väestöä vastaan ja hallita planeettaa. Kun tohtori Winston Cray sai tietää suunnitelmasta, hän vapautti "Thetan" ja mutageenisen viruksen Area 51:ssä hidastaakseen heitä. Tämä sai armeijan lähettämään paikalle nopean toiminnan joukon, jota johti majuri Bridges (Powers Boothe), eristämään ja rajoittamaan virusta. HAZMAT-tiimi Delta, ensimmäinen Area 51:een lähetetty tiimi, joutui "Theta"-olennon väijytykseen, kärsi tappioita ja vetäytyi syvemmälle tukikohtaan. HAZMAT-tiimi Bravo, johon kuuluivat tiimin johtaja Ramirez, McCan, Crispy ja operaation erikoisasiantuntija Ethan Cole, lähetettiin etsimään Delta-tiimiä.