Enix Corporationin kanssa tapahtuneen yhdistymisen jälkeen perustettiin osasto, joka keskittyi yksinomaan heidän lippulaivansa, Dragon Quest -sarjan, käsittelyyn.

Vuoden 2013 lopulla Square Enix kävi läpi yritysrakenteen uudistuksen, joka toi mukanaan liiketoimintaosastojen järjestelmän. Dragon Quest -sarjan pääkehitys siirtyi Liiketoimintaosasto 6:lle.