Apogee Software on videopelien julkaisija, jonka toimipaikka on Aalborgissa, Tanskassa. Scott Miller perusti yhtiön vanhempiensa kotiin Garlandissa, Texasissa, vuonna 1987 nimellä Apogee Software Productions julkaistakseen pelinsä Kingdom of Kroz. 1980-luvun lopulla ja 1990-luvun alussa yhtiö teki suosituksi jakelumallin, jossa jokainen peli koostui kolmesta jaksosta, joista ensimmäinen jaettiin ilmaiseksi shareware-versiona ja kaksi muuta olivat ostettavissa. Duke Nukem oli merkittävä Apogeen luoma pelisarja, joka hyödynsi tätä mallia, ja Apogee julkaisi samalla tavalla myös Commander Keen- ja Wolfenstein 3D -pelit.

Vuonna 1994 Apogee alkoi käyttää 3D Realms -nimeä 3D-pelien yhteydessä, ja vuonna 1996 yhtiö nimettiin uudelleen 3D Realmsiksi keskittyäkseen perinteisesti julkaistuihin 3D-peleihin. Duke Nukem 3D (1996) julkaistiin tämän nimen alla suurella menestyksellä. Tämän jälkeen 3D Realms lopetti suurelta osin julkaisutoimintansa ja kehityksensä keskittyäkseen kahteen pitkään viivästyneeseen peliin: Prey (2006), joka oli kehitteillä, kunnes toinen studio otti sen haltuunsa vuonna 2001, ja Duke Nukem Forever (2011), joka pysyi kehitteillä vuoteen 2009 asti. "Apogee Software" -nimen, kirjaston ja logon lisensoi Terry Nagy vuonna 2008, joka perusti Apogee Software LLC:n kehittämään ja julkaisemaan Apogeen pelien porttauksia ja spin-offeja.