Yhteenveto
Mountain of Faith -tapahtumien jälkeen kesä saapuu Gensokyoon epätavallisen sään saattelemana. Pian tämän oudon sään ilmestymisen jälkeen tapahtuu suuri maanjäristys, joka tuhoaa Hakurein temppelin, mikä saa Reimu Hakurein tutkimaan tapahtuman syytä.
Tarina
Gensokyossa tapahtuu kummallinen ilmiö. Keskellä kesää taianomaisessa metsässä sataa odottamattomasti vettä ja rakeita, Hakugyokuroun peittää lumikerros, Scarlet Devil Mansion on kietoutunut pilviseen, tiheään sumuun, ja Hakurein pyhäkkö tuhoutuu äkillisessä maanjäristyksessä. Pelin aikana Reimu ja muut päähenkilöt lähtevät selvittämään näiden outojen tapahtumien alkuperää.
Tenshi Hinanawi on taivaanolento. Hänestä taivaassa vietetty uusi elämä tuntuu tylsältä ja yksitoikkoiselta, ja hän katsoo kateellisena, kuinka Gensokyon youkait aiheuttavat erilaisia häiriöitä. Halliten maata ja omistaen jumalallisen Hisou-miekan, kyllästynyt taivaanolento päättää aiheuttaa omia katastrofejaan.
