Yhteenveto
Tultuaan Porombo Islandin legendaksi alkuperäisessä pelissä, Cody suuntaa kohti uutta maata ja uutta turnausta. Tilanne kuitenkin kääntyy huonompaan suuntaan, kun raju myrsky tuhoaa Codyn veneen ja heittää hänet ajelehtimaan merelle. Hän herää Majikon maassa sijaitsevassa vajassa, mutta kaikki ei ole kunnossa. Cody saa selville, että lähialueita terrorisoi Maskman joukkoineen. Järjestyksen palauttamiseksi Codyn täytyy matkustaa 20 vuotta menneisyyteen ja takaisin.
Tarina
Robopon 2 sijoittuu aikaan Robopon 2:n tapahtumien jälkeen. Cody huuhtoutuu Baba-kylän rantaan. Rekrytoituaan uuden Roboponin hän aikoo osallistua Legend1-tason haltijoiden turnaukseen, mutta viivästyy. Dr. Zero on selvinnyt edellisen pelin tapahtumista veljensä Dr. Zeken aikamatkailun ansiosta ja hänellä on nyt Legend0-taso. Kohdatakseen hänet Codyn täytyy voittaa Majikon tason haltijat. Monet heistä ovat piilottaneet X-kivet, joita tarvitaan taisteluun, mutta Cody onnistuu hankkimaan ne aikamatkailun avulla. Tämän aikana Cody taistelee kolmea Dr. Zeron luomaa Robopon-käyttäjä kyborgia vastaan. Lopulta Cody kohtaa usein koomisesti heikkovoimaisen Nick D:n, joka yrittää kerätä X-kiveä myydäkseen sen ja tukeakseen orpokotia, ja he käyvät kaksintaisteluita kivistä.