Yhteenveto
Star Control 2:n tapahtumien jälkeen Ur-Quanit on saatu rauhoittumaan, ja kapteeni, joka rohkeasti tuhosi Sa-Matran, on saanut hirvittävän näyn tulevaisuudesta. Yhtäkkiä, ilman ennakkovaroitusta, kaikki hyperspace-matkat universumissa ovat pysähtyneet. Huipputiedemiehet ovat paikallistaneet tämän häiriön syyn tutkimattomaan avaruuteen, alueelle, joka tunnetaan nimellä Kessarin kvadrantti. Kiireellisesti kooten laivaston aluksia ja testaamattoman Precusor-tähtimoottorin… Vapaiden Rotujen Liigana tunnettu löyhä muukalaisrotujen liittouma lähettää iskujoukon Kessarin kvadranttiin. Sinä olet sen komentaja.
Star Control 3 esittelee uuden 3D-tähtikartan, uusia muukalaisrotuja löydettäväksi, uusia maailmoja tutkittavaksi ja kolonisoitavaksi, uusia artefakteja tutkittavaksi sekä uuden isometrisen Hyper Melee -taistelujärjestelmän tähtialusten välisiin taisteluihin.