Kehitysosasto 3 jatkaisi Final Fantasy XI Onlinen kehittämistä sulautumisen jälkeen Enix Corporationin kanssa.

He kehittäisivät useita laajennuksia ja alkaisivat lopulta 2000-luvun lopulla kehittää Final Fantasy XIV Onlinea. Alkuperäisen julkaisun jälkeen peli rakennettaisiin uudelleen juuri mukaan liittyneen Naoki Yoshidan valvonnassa ja saisi nimekseen Final Fantasy XIV: A Realm Reborn.

Vuoden 2013 lopussa he sulautuisivat Square Enix Business Division 5:een.