Yhteenveto
Elokuvan tapahtumien jälkeen Duke ja Scarlett matkustavat arktiselle alueelle ja vapauttavat Heavy Dutyn, Ripcordin ja Snake Eyesin M.A.R.S.:in vankilasta. He myös taistelevat Baronessea vastaan ja vievät hänet Pitiin. Egyptissä Joet saavat selville, että Cobra on ottamassa Apep-jalokiven, ja heidän täytyy voittaa Firefly. Viidakossa Joet huomaavat, että Cobra rakentaa pyramidin kaltaista rakennusta keskelle viidakkoa. Sieltä heidän on voitettava James McCullen (joka nyt tunnetaan nimellä Destro) pyramidirakennuksen katolla. Lopulta heidän on kukistettava Cobra Commander ja Storm Shadow Pohjoisella magneettisella navalla sijaitsevassa tulivuorotukikohdassa.